내 여동생이 이렇게 귀여울 리가 없어。

쿄스케는 다시 여동생 키리노와 한 지붕 아래 살아가며, 예전보다 더 솔직하게 서로의 마음을 마주하려 애쓴다. 오타쿠 친구 사오리와 쿠로네코, 키리노의 '평범한' 친구 아야세 등 주변 인물들과 얽힌 에피소드가 이어지는 가운데, 쿄스케와 키리노 사이에 흐르던 미묘한 감정은 점점 무시할 수 없는 크기로 자라난다.